С точки зрения закона, внести изменения от руки можно, если обе стороны поставят подписи под такими изменениями. Если же под исправлениями будет стоять только ваша подпись, то есть очень большая вероятность, что Росреестр откажет в проведении государственной регистрации. Ничего исправлять от руки в акте не нужно.
Чтобы этого избежать, подготовьте и направьте застройщику отказ от подписания акта и в качестве причины отказа укажите ваши претензии по срокам и ремонту.
Если вам необходима консультация, то вы можете задать ваш вопрос специалисту здесь.